Ma’had Aliy Markaz Siyasi merupakan lembaga pendidikan yang memiliki spesifikasi khusus dalam pendidikan ilmu politik dan peradaban Islam. Lembaga ini merupakan pionir dalam bidangnya, mengingat belum ada lembaga serupa yang memiliki konsentrasi dalam ilmu politik dan peradaban Islam. Markaz Siyasi dilatarbelakangi oleh dua alasan utama; Pertama, kehadiran lembaga ini merupakan tuntutan kondisi keummatan yang kian terpuruk oleh peradaban asing dalam hal ini peradaban kapitalisme. Masyarakat secara umum diatur oleh sistem non-ilahiyah yang tidak berasal dari wahyu sembari mencampakan al-Qur’an dan as-Sunnah hanya tersimpan di ‘lembari-lemari penuh debu’. Sehingga, dalam rangka mewujudkan kebutuhan Umat Islam agar diatur oleh solusi-solusi kehidupan yang bersumber dari al-Qur’an dan as-Sunnah, Markaz Siyasi berupaya menjadi lumbung konsepsi alternatif dimana aqidah Islam sebagai satu-satunya pondasi dalam melahirkannya. Kedua, lembaga ini hadir dalam rangka mengungkap sisi lain dari Islam yang umum dipahami masyarakat hanya sekedar agama spiritual. Anggapan semacam itu menyebabkan kekosongan pengaturan umat dari aspek Politik diisi oleh konsepsi politik asing.